Альфою та омегою фаготерапії є застосування з лікувальною метою виключно літичних фагів, які вбивають бактерії-мішені, а не помірних (лізогенних), які можуть вбудовуватися свій геном у бактеріальну ДНК та спокійно існувати так тривалий час. До того ж помірні фаги можуть переносити гени між бактеріями, що несе певні загрози, зокрема поширення генів антибіотикорезистентності. Але виявилося, що у боротьбі з патогенними бактеріями можуть бути корисними й помірні фаги, а точніше, фаги, які вже знаходяться у бактеріях-мішенях у формі профагів.

Новий метод лікування отримав назву « Індукована нативна фаготерапія ». Він не передбачає введення в організм людини або тварини будь-яких фагів, зате він покликаний «розбудити» лізогенні фаги, які зазвичай є в будь-якій бактерії у формі профагів. Нагадаємо, що профаг – це геном фага, вбудований у ДНК бактерії. Профаг є непатогенним для бактерії і може багато поколінь відтворюватися разом з бактеріальною хромосомою. Але під впливом різних факторів може статися індукція профагу і він стане інфекційним – перетвориться на вегетативний фаг та почне розмножуватися, що призведе до лізису та загибелі бактеріальної клітини.

Читайте також: Золоті наночастинки як контролери для фагів

Нативна фаготерапія ґрунтується на тому, що кожна бактерія, яка інфікує людський організм, вже містить у своєму геномі різні профаги. Якщо їх індукувати, вони знищать бактерію, а потім, коли довкола не залишиться бактерій-мішеней, зникнуть самі. Для індукції профагів пропонується використання силіконові наночастинки у фізіологічному розчині, які є носіями та передавачами певних електромагнітних сигналів, які власне і мають «розбудити» профаг у бактеріях-мішенях.

Метод був випробуваний на борреліях ( Borrelia spp.) - Бактеріях, до яких відноситься збудник хвороби Лайма (бореліозу), що переноситься кліщами. У дослідженні 300 пацієнтів, які мали позитивний тест на один або кілька штамів боррелій, протягом 5 днів отримували нативну фаготерапію, після чого тест на інфекцію у всіх учасників став негативним. Під час хвороби Лайма збудник може бути в неактивному стані (такі клітини бактерій називають персистерами), тому тест повторили через 45-60 днів після завершення нативної фаготерапії, і він також у 100% учасників був негативним. У них не було побічних ефектів, елімінація боррелій не супроводжувалася токсичними або алергічними реакціями.

Нативна фаготерапія, на відміну від звичайної, не вимагає пошуку специфічних до конкретного збудника літичних фагів у бібліотеках чи навколишньому середовищі. Метод не веде до знищення нецільових бактерій, не потребує здорової імунної системи, дозволяє знищувати бактерії у біоплівках, а також діяти на збудників у головному мозку. Правда, для кожного роду бактерій потрібно підбирати специфічні електромагнітні сигнали для індукції профагів, що мешкають у їх геномах.