Завантаження...

Бактериофаги – обитатели кишечника человека

 

Микрофлора (микробиом) кишечника человека представляет собой плотное и таксономически разнообразное сообщество микроорганизмов. Если бактериям кишечного микробиома уделяется знаительное внимание, то сравнительно мало известно о составе и физиологическом значении бактериофагов, обитающих в кишечнике человека (их совокупность по аналогии с микробиомом называют «фагОм»). Предполагается, что в кишечнике обитает более 1012 вирусов, которые играют важную роль в регуляции сложных микробных взаимодействий и контроле численности микробных популяций.

В феврале 2019 г. в журнале Cell Host & Microbe была опубликована статья Andrey N. Shkoporov и Colin Hill*, посвященная методам изучения и характеристики фагома человека. Если ранее в исследованиях фагов основными методами считались культуральные методы и микроскопия, то сегодня в распоряжении ученых появились методы метагеномики и протеомики, особенно полезные для изучения некультивируемых фагов, а также биоинформатики.

Авторы статьи отмечают, что кишечный фагом может у людей значительно различаться, и его состав зависит от многих факторов, начиная от способа рождения (естественным путем или с помощью кесарева сечения) до возраста человека. Среди фагов встречаются как литические, так и умеренные, и баланс меду ними важен для поддержания гомеостаза на слизистой кишечника. Изменения в составе фагома отмечаются при различных состояниях и заболеваниях: голодании, приобретенных иммунодефицитах, воспалительных заболеваниях кишечника и т.д.

Исследование всего разнообразия кишечных вирусов – сложная задача, однако без них наши представления о кишечной экосистеме и ее взаимодействии с организмом хозяина остаются неполными.

* Shkoporov AN, Hill C. Bacteriophages of the human gut: the “known unknown” of the microbiome. Cell Host Microbe. 2019; 25(2):195-209. doi: 10.1016/j.chom.2019.01.017.