В кишечнику людини в нормі мешкають не тільки бактерії (мікробіом), а й віруси (віром), переважно бактеріофаги. Але як вони взаємодіють з бактеріями, поки не дуже зрозуміло

На сьогодні вчені не так вже й багато знають про кишковий мікробіом, але про віром відомо ще менше. Щоб дізнатися більше, дослідники з Університету Корку (Ірландія) вивчали* кишковий віром дев’яти осіб протягом року та однієї особи – протягом двох років. Вони знайшли, що в кишечнику людини живе багато типів бактеріофагів і що їх склад є індивідуальним.

В результаті дослідження було створено базу даних кишкових бактеріофагів, яка може значно поглибити наше розуміння того, як фаги впливають на здоров’я людини. Отримані дані показують, що на відміну від мікробіому, «ядро» якого у різних людей одне й те саме, віром значно варіює. Це означає, що одні й ті самі бактерії у різних індивідів є господарями для різних бактеріофагів.

В дослідженні* збирали зразки калу 10 осіб – 4 чоловіків та 6 жінок – кожного місяця протягом року. В однієї жінки зразки додатково отримали на 19, 20 та 26 місяць спостереження. Зі зразків виділяли вірусні частки та визначали послідовність вірусного геному. Через те що 99% кишкових вірусів невідомі науці, визначити їх поки немає можливості. Отже вчені зайнялися пошуками кодуючи послідовностей вірусної ДНК та аналізом білків, які ті можуть кодувати, та їх збігів із білками в наявних базах даних. Вчені знайшли, що у віромах представлено багато вірулентних бактеріофагів – таких, які для розмноження потребують знищення бактерії-господаря.

Поки мікробіологи дуже мало знають про взаємодію бактеріофагів та бактерій кишечнику людини, але безсумнівно, дослідження мікробіому в нормі та при патологічних станах потребують також вивчення вірому. Цікавим є дослідження того, як виглядає віром здорової людини, як віром залежить від способу життя, місця проживання, етнічної приналежності. Зрозумівши, що є нормою, буде легше розібратися з патологічними станами, які пов’язані зі зміною складу вірусів у кишечнику.

* Shkoporov A., Clooney AG, Sutton TDS et al. The human gut virome is highly diverse, stable, and individual specific // Cell Host & Microbe, 2019, 26 (4): P527-541.E5. DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.09.009