Завантаження...

Доставка препаратов курьером и службой доставки «Новая Почта». Прием заказов по телефону 0-800-307-407

Составлен каталог бактериофагов, населяющих кишечник человека

 

Ученые составили* самый полный на сегодня каталог бактериофагов, обитающих в кишечнике человека. Ученым удалось выявить более 142 тыс. геномов вирусов бактерий и установить некоторые их особенности

Вирусы бактерий – бактериофаги – самые многочисленные биологические объекты на Земле. Они есть везде, где есть бактерии, в том числе, в кишечнике человека. Бактериофаги играют важную роль в жизнедеятельности микробных сообществ, в частности регулируют численность бактерий, осуществляют горизонтальный перенос генов между бактериями. С учетом важной роли кишечной микробиоты в функционировании человеческого организма не удивительно, что не только кишечные бактерии, но и их паразиты – бактериофаги – вызывают возрастающий интерес ученых.

Новые технологии высокопроизводительного секвенирования (установления нуклеотидной последовательности ДНК) позволили ученым выявить множество новых вирусов в кишечнике человека, в том числе таких, которые сложно классифицировать согласно таксономии, установленной Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV). Ученые из Института Сенгера и Европейского института биоинформатики EMBL-EBI (Великобритания) с применением методов метагеномики проанализировали 28 060 проб кишечной микрофлоры, собранных в 28 странах Европы, Азии, Америки, Африки, Океании, а также 2 898 геномов бактерий из кишечника человека. В пробах было обнаружено 142 809 геномов фагов, обитающих в кишечнике человека, причем более половины из них ранее не были описаны.

Читайте также: Бактериофаги как компоненты пробиотиков: эффективность доказана

Наибольшее разнообразие бактериофагов оказалось характерно для бактерий типа фирмикуты, к которым относятся и лактобактерии, и клостридии, и стафилококки, и стрептококки. В образцах ученые идентифицировали представителей новой многочисленной фаговой клады, которую назвали губафагами (Gubaphage). Губафаги заражают грамотрицательные анаэробные палочковидные бактерии семейства Bacteroidaceae.

Ученые обнаружили, что фагеОмы (совокупность фаговых геномов в образце, выделенном из одного организма, названная по аналогии с геномом, микробиомом, протеомом) жителей Северной Америки, Европы и Азии отличаются от таковых жителей Африки и Южной Америки. При этом состав фагеомов коррелировал с некоторыми различиями в образе жизни человека, например, различались фагеомы городских и сельских жителей.

Авторы исследования отмечают, что сделали важный шаг на пути исследования человеческого микробиома и роли вирусов в его эволюции и функционировании.

* Camarillo-Guerrero LF, Almeida A, Rangel-Pineros G et al. Massive expansion of human gut bacteriophage diversity // Cell, 2021; 184 (4): 1098. DOI: 10.1016/j.cell.2021.01.029