Завантаження...

Состав бактериофагов в кишечнике человека индивидуален

 

В кишечнике человека в норме обитают не только бактерии (микробиом), но и вирусы (виром), преимущественно бактериофаги. Но как они взаимодействуют с бактериями, пока не очень понятно

На сегодня ученые не так уж много знают о кишечном микробиоме, но о вироме известно еще меньше. Чтобы узнать больше, исследователи из Университета Корка (Ирландия) изучали* кишечный виром девяти человек в течение года и одного человека - в течение двух лет. Они установили, что в кишечнике человека живет много типов бактериофагов и их состав индивидуален.

В результате исследования была создана база данных кишечных бактериофагов, которая может значительно углубить наше понимание того, как фаги влияют на здоровье человека. Полученные данные показывают, что в отличие от микробиома, состав которого у разных людей во многом совпадает, виром значительно варьирует. Это означает, что одни и те же бактерии у разных индивидов являются хозяевами разных бактериофагов.

В исследовании* собирали образцы кала 10 человек - 4 мужчин и 6 женщин - каждый месяц в течение года. У одной женщины образцы дополнительно получили на 19, 20 и 26 месяц наблюдения. Из образцов выделяли вирусные частицы и определяли последовательность вирусного генома. Так как 99% кишечных вирусов неизвестные науке, определить их пока нет возможности. Поэтому ученые занялись поисками кодирующих последовательностей вирусной ДНК и анализом белков, которые те могут кодировать, и их совпадений с белками в существующих базах данных. Ученые обнаружили, что в вироме представлено много вирулентных бактериофагов - таких, которые для размножения нуждаются в уничтожении бактерии-хозяина.

Пока микробиологи очень мало знают о взаимодействии бактериофагов и кишечных бактерий человека, но, несомненно, исследования микробиом в норме и при патологии требуют также изучения вирома. Было бы полезно выяснить, как выглядит виром здорового человека, как он зависит от образа жизни, места проживания, этнической принадлежности и т.д. Выяснив, что является нормой, будет легче разобраться с патологическими состояниями, связанными с изменением состава вирусов в кишечнике.

* Shkoporov A., Clooney AG, Sutton TDS et al. The human gut virome is highly diverse, stable, and individual specific // Cell Host & Microbe, 2019, 26 (4): P527-541.E5. DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.09.009